С 1 января 2015 года компании на упрощенке, которые выставляют счета-фактуры с НДС, должны отражать данные каждого из них в декларации по НДС (п. 5.1 ст. 174 НК РФ). Для этого в новой форме декларации отведен раздел 12. А сдавать ее понадобится начиная с отчетности за I квартал 2015 года не позднее 27 апреля. Причем в электронном виде. За несданную и бумажную отчетность налоговики вправе заблокировать счет (п. 11 ст. 76 НК РФ). Подробно об этой и трех других причинах блокировки счета читайте в статье «Четыре причины, по которым счета компании будут заблокированы».
Кстати, узнать о том, что компания на упрощенке выставляет счета-фактуры с НДС, но не отчитывается и перечисляет его в бюджет, инспекторам теперь будет довольно просто. Поскольку все счета-фактуры (и входящие, и исходящие) отражаются теперь в декларациях, налоговики увидят заявленный к вычету НДС у покупателя.